スキルは、機体に応じて習得できるものが決まっています。
また、スキルを覚えるタイミングは、ミッションをクリアした後になります。
どのようなスキルを覚えるかはメニュー画面から確認が可能です。
そのメニュー画面に表示されているパーセンテージは、クリア後にそのスキルを覚える確率となっています。決して、そのパーセンテージを上げていくことで覚えるというわけではありません。
また、そのパーセンテージは、パイロットレベルや機体のパーツのレベルを上げていくことで上がっていき、覚えやすくなります。
最初は0%のものでも、後々覚えられるようになりますので、あまり気にせずプレイしていきましょう。